HCl может выступать в качестве катализатора или реагента в фармацевтическом синтезе, облегчая производство важных соединений. Он особенно используется в реакциях, связанных с образованием солей аминов и реакциях, катализируемых кислотами, что способствует созданию множества жизненно важных лекарств.